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DNA分子结构3D模型

Posted on 2014-08-21 15:07 TWaver 阅读(594) 评论(0)   编辑   收藏

生物信息资源更新越来越快,使用可视化的方法来分析DNA序列已成为生物信息学的一个研究热点,用图形表示DNA序列的方法也越来越成熟。2011年，著名杂志《Science》发表一篇引起轰动的文章:《Presenting the Human Genome:Now is 3D!》,这篇文章完全给我们描述了人类基因组测序未来的蓝图，可见3D技术在很多领域都是发展方向。
使用mono可以快速的创建DNA分子结构立体模型，效果如下：



当然简单的呈现DNA分子结构，仅仅是一部分功能，如果将mono和专业的DNA分析仪结合，不仅可以发现病症，更重要的是预测病症的发生，治病于未发，这将是人类的福音。除了研究人类基因之外，我们还可以对农作物的进行DNA3D模型化，并加以分析，对农业的发展和粮食安全方面都会有积极的意义。
使用mono创建3D模型最大的特点就是快，代码不过几十行，使用Editor更是不需要代码量。本文的效果图通过代码实现，核心代码如下：

1function createDNA(box, x, y, z, colors){
2    var count=20+Math.random()*50;
3    var dist=50;
4    var parent=createNode(box, 10, 0,0,0,'red');
5    for(var i=0;i<count;i++){               
6            var angle=Math.PI*2/360*15*i;
7        var radius = (i % 2==0) ? 10 : 7;
8        var color = colors[i%2]
9        var node1=createPairNode(box, dist, radius, i, angle, color);
10        var node2=createPairNode(box, dist*0.3, radius, i, angle, color);
11        node1.setParent(parent);
12        node2.setParent(parent);
13 
14        if(i % 2==0){
15        var link=createLink(box, node1, node2, dist, angle, 'gray');
16        var node3=createPairNode(box, dist*0.58, radius*0.4, i, angle,'cyan');
17        var node4=createPairNode(box, dist*0.72, radius*0.4, i, angle,'cyan');
18        link.setParent(parent);
19        node3.setParent(parent);
20        node4.setParent(parent);
21        }
22    }
23    parent.setPosition(x,y,z);
24        parent.setStyle('m.visible',false);
25        return parent;
26}
view source
print ?
1function createPairNode(box, size, radius, index, angle, color){
2    var x=size*Math.sin(angle);
3    var z=size*Math.cos(angle);
4    var y=index * 10;                      
5    var node = createNode(box, radius, x, y, z, color);
6    return node;
7}
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